新生儿查足底血一般是查苯丙酮尿症、甲状腺功能低下这两种先天性疾病。

1、苯丙酮尿症：苯丙酮尿症是常见的氨基酸代谢病，主要是由于染色体的隐形遗传导致，这个疾病不及时的治疗会导致新生儿的智力发育落后、生长发育缓慢等，所以出生后抽血筛查便于及时发现，尽早治疗。

2、甲状腺功能低下：需要检查新生儿甲状腺的情况，甲状腺功能低下也存在一定的遗传性，新生儿患有这个疾病会导致智力发育落后、身体受到损伤，出现呆小症等，新生儿抽血筛查便于早期发现，及时补充甲状腺素，降低影响孩子发育的因素。

新生儿查足底血主要是查新生儿有无先天性疾病，便于早发现早治疗，避免影响新生儿的发育与成长。