一般来说，婴幼儿做核磁共振不会对身体有影响，具体如下：

核磁共振的原理是在外加磁场的作用下，使体内的氢原子核产生运动，从而成像的一种检查方法，这种检查方法没有辐射，属于无创检查方法之一，不会对婴幼儿产生不良影响，有时在疾病需要的情况下，婴幼儿可以选择做此项检查。

需要注意的是，有些婴幼儿在做核磁时可能会因为机器的噪音、陌生的环境和本身疾病的不舒服导致出现哭闹等情况，需要家长对孩子的情绪进行安抚，这也有助于提高核磁检查的质量。

医生建议给婴幼儿做核磁共振，都出于对目前疾病诊疗的需要，这是一个无创无害的检查，家长们不必过于担心。