通常情况下，三个月宝宝从床上摔下来头上有包，可能是皮肤擦伤、头部血肿、颅骨骨折等原因引起的。可以通过物理治疗、应用药物、手术治疗等方式缓解。

1、皮肤擦伤：如果宝宝从床上摔下来导致外皮擦伤，外伤可能造成皮肤的硬性损伤，从而导致头皮起包。如果宝宝精神状态良好，没有明显的不适症状，家长可以用生理盐水、碘伏等消毒伤口，让宝宝卧床休息，从而利于尽快恢复。

2、头部血肿：宝宝摔到头部后，可能引起皮下血管破裂出血，导致宝宝出现头部血肿、疼痛等症状。家长可以在宝宝受伤24小时内进行冷敷，24小时后用热毛巾热敷充血部位，促进局部血液循环，从而有利于消肿。也可在医生的指导下使用云南白药、对乙酰氨基酚等药物进行治疗。

3、颅骨骨折：宝宝摔到头部后可能会造成颅骨骨折，导致硬膜外伤或者颅内血肿，表现为头上摸起来有包块，可以遵医嘱通过手术方式来治疗。

除以上常见原因外，还有可能是脑挫裂伤等引起的，家长应及时带宝宝去医院进行检查，查明病因，在医生指导下进行相应处理。