小儿病毒性心肌炎预后取决于病毒性心肌炎的严重程度。如果是轻度小儿病毒性心肌炎，仅表现心肌有点水肿、心肌细胞有点破坏、心电图有点改变、心脏有点轻度增大这些表现，预后都很好，一般都能恢复。重症心肌炎已出现心功能降低、心脏明显增大、孩子有明显症状、有明显浮肿、明显活动耐力下降、肝脏肿大，这种孩子可能预后就相对不好，可能需要长期的治疗，甚至有的孩子还可能会影响到生命。还会出现心肌炎后遗症，心肌炎后遗症主要包括：出现心律失常，常见的有三度房室传导阻滞等，有的需要安装起搏器治疗，还有留下房室传导阻滞，需要一些心脏再同步化治疗，这都是需要慢性的长期的治疗的手段。对于有些心肌炎，如果是持续的不恢复，心脏持续的增大，心功能持续的降低，慢慢变成扩张心肌病，可能对寿命、对长期生存就有影响。有些病毒性心肌炎，如果再有遗传背景，心肌炎预后可能非常不好。因此小儿病毒性心肌炎的预后，主要取决于心肌炎严重程度及对药物治疗反应。